El análisis del transcriptoma revela un patrón de expresión génica mayor y vías metabólicas importantes en el control de la heterosis en el repollo chino
Autores: Li, Ru; Nie, Shanshan; Zhang, Ning; Tian, Min; Zhang, Lugang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El análisis del transcriptoma revela un patrón de expresión génica mayor y vías metabólicas importantes en el control de la heterosis en el repollo chino
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Base molecular
Secuenciación de ARN
Genes expresados diferencialmente
Patrón de expresión dominante
Interacción planta-patógeno
Ritmo circadiano-plantas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Aunque la heterosis se utiliza comúnmente en el repollo chino, su base molecular se comprende poco. En este estudio, se utilizaron 16 híbridos de repollo chino como sujetos de prueba para explorar el posible mecanismo molecular de la heterosis. La secuenciación de ARN reveló entre 5815 y 10,252 genes expresados diferencialmente (GEDs) (padre femenino vs. padre masculino), entre 1796 y 5990 GEDs (padre femenino vs. híbrido) y entre 2244 y 7063 GEDs (padre masculino vs. híbrido) en 16 combinaciones de cruces en la etapa media de la espigación. Entre ellos, el 72.83-84.20% de los GEDs se ajustaron al patrón de expresión dominante, que es el patrón de expresión predominante en los híbridos. Hubo 13 vías en las que los GEDs se enriquecieron significativamente en la mayoría de las combinaciones de cruces. Entre ellas, la interacción planta-patógeno (ko04626) y el ritmo circadiano-planta (ko04712) se enriquecieron significativamente por los GEDs en híbridos de fuerte heterosis. WGCNA también demostró que las dos vías estaban significativamente relacionadas con la heterosis en el repollo chino.
Descripción
Aunque la heterosis se utiliza comúnmente en el repollo chino, su base molecular se comprende poco. En este estudio, se utilizaron 16 híbridos de repollo chino como sujetos de prueba para explorar el posible mecanismo molecular de la heterosis. La secuenciación de ARN reveló entre 5815 y 10,252 genes expresados diferencialmente (GEDs) (padre femenino vs. padre masculino), entre 1796 y 5990 GEDs (padre femenino vs. híbrido) y entre 2244 y 7063 GEDs (padre masculino vs. híbrido) en 16 combinaciones de cruces en la etapa media de la espigación. Entre ellos, el 72.83-84.20% de los GEDs se ajustaron al patrón de expresión dominante, que es el patrón de expresión predominante en los híbridos. Hubo 13 vías en las que los GEDs se enriquecieron significativamente en la mayoría de las combinaciones de cruces. Entre ellas, la interacción planta-patógeno (ko04626) y el ritmo circadiano-planta (ko04712) se enriquecieron significativamente por los GEDs en híbridos de fuerte heterosis. WGCNA también demostró que las dos vías estaban significativamente relacionadas con la heterosis en el repollo chino.