La presencia de cáscaras de huevo translúcidas es un tipo de problema de calidad del huevo que impacta en las ventas de huevos. Aunque muchos investigadores las han estudiado, los mecanismos exactos detrás de su formación siguen siendo poco claros. En este estudio, realizamos un análisis de expresión diferencial transcriptómica de la región del istmo del oviducto en gallinas ponedoras de huevos normales y de huevos translúcidos. El análisis reveló que las vías génicas expresadas diferencialmente estaban predominantemente concentradas en la síntesis, modificación y transporte de proteínas de la membrana de la cáscara del huevo, particularmente proteínas de colágeno, que proporcionan soporte estructural. Estos hallazgos sugieren que las variaciones en la estructura física de la membrana de la cáscara del huevo, resultantes de cambios en su composición química, son la causa fundamental de la formación de cáscaras de huevo translúcidas. Esta investigación proporciona una referencia teórica para reducir la ocurrencia de huevos translúcidos.