Transcriptoma de Múltiples Tejidos de Anguila Zig-Zag () con Diferentes Tasas de Crecimiento
Autores: Yang, Jinlin; Lu, Baoyue; Yu, Zhide; Zhang, Linan; Chen, Yiman; Chen, Zihui; Han, Chong; Shu, Hu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Transcriptoma de Múltiples Tejidos de Anguila Zig-Zag () con Diferentes Tasas de Crecimiento
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Secuenciación del transcriptoma
Rasgos de crecimiento
DEGs
Proteína de unión al factor de crecimiento similar a la insulina
Miosina
Ontología de Genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Para explorar los principales genes reguladores y las vías relacionadas con los rasgos de crecimiento, se realizó primero la secuenciación del transcriptoma en los tejidos del cerebro, hígado y músculo de individuos de 3 meses con diferentes tasas de crecimiento. A través del análisis comparativo del transcriptoma de grupos de rápido y lento crecimiento, se seleccionaron un total de 2887 genes expresados diferencialmente (DEGs), de los cuales se detectaron 59 genes sobreexpresados y 105 genes subexpresados en el cerebro, 146 genes sobreexpresados y 202 genes subexpresados en el hígado, y 529 genes sobreexpresados y 1846 genes subexpresados en el músculo, incluyendo la proteína de unión al factor de crecimiento similar a la insulina 1a, la proteína de unión al factor de crecimiento similar a la insulina 1b, la miosina, la cadena ligera 1, y la mioglobina. A través del análisis de enriquecimiento de Gene Ontology (GO) y de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG), identificamos un total de 288 entradas GO significativamente enriquecidas y 68 vías KEGG significativamente enriquecidas relacionadas con el crecimiento, como el desarrollo del tejido muscular esquelético, la unión al factor de crecimiento similar a la insulina y el ciclo celular mitótico. Estos genes clave y vías de señalización pueden desempeñar un papel fundamental en la regulación del crecimiento. Profundizar en los mecanismos regulatorios de estos genes clave proporcionará una base teórica para la exploración adicional de los mecanismos moleculares relacionados con el crecimiento y desarrollo, y ayudará a criar nuevas variedades con un crecimiento rápido.
Descripción
Para explorar los principales genes reguladores y las vías relacionadas con los rasgos de crecimiento, se realizó primero la secuenciación del transcriptoma en los tejidos del cerebro, hígado y músculo de individuos de 3 meses con diferentes tasas de crecimiento. A través del análisis comparativo del transcriptoma de grupos de rápido y lento crecimiento, se seleccionaron un total de 2887 genes expresados diferencialmente (DEGs), de los cuales se detectaron 59 genes sobreexpresados y 105 genes subexpresados en el cerebro, 146 genes sobreexpresados y 202 genes subexpresados en el hígado, y 529 genes sobreexpresados y 1846 genes subexpresados en el músculo, incluyendo la proteína de unión al factor de crecimiento similar a la insulina 1a, la proteína de unión al factor de crecimiento similar a la insulina 1b, la miosina, la cadena ligera 1, y la mioglobina. A través del análisis de enriquecimiento de Gene Ontology (GO) y de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG), identificamos un total de 288 entradas GO significativamente enriquecidas y 68 vías KEGG significativamente enriquecidas relacionadas con el crecimiento, como el desarrollo del tejido muscular esquelético, la unión al factor de crecimiento similar a la insulina y el ciclo celular mitótico. Estos genes clave y vías de señalización pueden desempeñar un papel fundamental en la regulación del crecimiento. Profundizar en los mecanismos regulatorios de estos genes clave proporcionará una base teórica para la exploración adicional de los mecanismos moleculares relacionados con el crecimiento y desarrollo, y ayudará a criar nuevas variedades con un crecimiento rápido.