El perfilado del transcriptoma revela la expresión diferencial de genes de lacasa en KC462061 durante la biodegradación de petróleo crudo
Autores: Alharbi, Nada K.; Alzaban, Mayasar I.; Albarakaty, Fawziah M.; Abd El-Aziz, Abeer R. M.; AlRokban, Ahlam H.; Mahmoud, Mohamed A.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
El perfilado del transcriptoma revela la expresión diferencial de genes de lacasa en KC462061 durante la biodegradación de petróleo crudo
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Lacasas fúngicas
Biodegradación
Petróleo crudo
KC462061
Compuesto Cu-ABTS
Perfil de transcripción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
Las lacasas fúngicas tienen una alta eficiencia catalítica y se utilizan para la eliminación de petróleo crudo porque oxidan varios hidrocarburos alifáticos y aromáticos y los convierten en compuestos inofensivos o menos tóxicos, acelerando así el potencial de biodegradación del petróleo crudo. Las lacasas son familias de genes importantes y la función de los genes de lacasas varía ampliamente según la transcripción y la función. La biodegradación del petróleo crudo utilizando KC462061 se estudió en el presente estudio, además del nivel de transcripción de ocho genes de lacasa que han participado en la biodegradación en presencia de compuestos aromáticos y iones metálicos. Los perfiles de actividad de lacasa a lo largo del tiempo en presencia de petróleo crudo indicaron que los cinco inductores, individuales o combinados, tienen un efecto muy positivo en la actividad de lacasa. En el estado de existencia de petróleo crudo, el efecto sinérgico del compuesto Cu-ABTS causó un aumento en los rendimientos de lacasa de hasta 22 veces después de 10 días en comparación con el control. Las eficiencias de biodegradación de KC462061 para hidrocarburos alifáticos y aromáticos del petróleo crudo fueron del 82.1 +/- 0.2% y 77.4 +/- 0.6%, respectivamente. La eficiencia de biodegradación del petróleo crudo se mejoró con el compuesto Cu-ABTS suplementado en KC462061. La cromatografía de gases-espectrometría de masas fue una herramienta muy precisa para demostrar las eficiencias de biodegradación de KC462061 para el petróleo crudo. Se observaron diferencias significativas en las intensidades de bandas de proteínas de lacasa en el SDS-PAGE de KC462061 después de la adición de cinco inductores, pero el compuesto Cu-ABTS afecta de manera muy particular la electroforesis de lacasa. La reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qPCR) se utilizó para el análisis del perfil de transcripción de ocho genes de lacasa en KC462061 con un gen de referencia verificado. Los iones de Cu y Cu-ABTS fueron altamente efectivos para un perfil de expresión de lacasa eficiente, principalmente a través de la inducción de transcripción. El presente estudio explicará la base teórica para la transcripción de lacasa en KC462061, allanando el camino para la comercialización y el uso.
Descripción
Las lacasas fúngicas tienen una alta eficiencia catalítica y se utilizan para la eliminación de petróleo crudo porque oxidan varios hidrocarburos alifáticos y aromáticos y los convierten en compuestos inofensivos o menos tóxicos, acelerando así el potencial de biodegradación del petróleo crudo. Las lacasas son familias de genes importantes y la función de los genes de lacasas varía ampliamente según la transcripción y la función. La biodegradación del petróleo crudo utilizando KC462061 se estudió en el presente estudio, además del nivel de transcripción de ocho genes de lacasa que han participado en la biodegradación en presencia de compuestos aromáticos y iones metálicos. Los perfiles de actividad de lacasa a lo largo del tiempo en presencia de petróleo crudo indicaron que los cinco inductores, individuales o combinados, tienen un efecto muy positivo en la actividad de lacasa. En el estado de existencia de petróleo crudo, el efecto sinérgico del compuesto Cu-ABTS causó un aumento en los rendimientos de lacasa de hasta 22 veces después de 10 días en comparación con el control. Las eficiencias de biodegradación de KC462061 para hidrocarburos alifáticos y aromáticos del petróleo crudo fueron del 82.1 +/- 0.2% y 77.4 +/- 0.6%, respectivamente. La eficiencia de biodegradación del petróleo crudo se mejoró con el compuesto Cu-ABTS suplementado en KC462061. La cromatografía de gases-espectrometría de masas fue una herramienta muy precisa para demostrar las eficiencias de biodegradación de KC462061 para el petróleo crudo. Se observaron diferencias significativas en las intensidades de bandas de proteínas de lacasa en el SDS-PAGE de KC462061 después de la adición de cinco inductores, pero el compuesto Cu-ABTS afecta de manera muy particular la electroforesis de lacasa. La reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qPCR) se utilizó para el análisis del perfil de transcripción de ocho genes de lacasa en KC462061 con un gen de referencia verificado. Los iones de Cu y Cu-ABTS fueron altamente efectivos para un perfil de expresión de lacasa eficiente, principalmente a través de la inducción de transcripción. El presente estudio explicará la base teórica para la transcripción de lacasa en KC462061, allanando el camino para la comercialización y el uso.