Hay pocos informes sobre la biología reproductiva del apio, que produce pequeñas flores en un largo período de floración. El desarrollo de las anteras fue analizado mediante secciones de parafina y los genes relacionados fueron examinados mediante secuenciación de transcriptomas y qPCR. El proceso de desarrollo se dividió en nueve etapas basadas en los cambios significativos en las morfologías celulares y de tejidos. Estas etapas incluyeron: etapa arquesporial, etapa de células esporógenas, etapa de células madre de microsporas, etapa de diada y tétrada, etapa de microspora mononuclear, etapa de microspora uninucleada tardía, etapa de célula binuclear, etapa de polen maduro y etapa de dehiscencia. Un total de 1074 genes diferencialmente expresados fueron identificados mediante secuenciación de transcriptomas en el capullo de flor temprano, capullo de flor medio y período de floración temprana. La anotación funcional indicó que estos genes estaban involucrados en procesos fisiológicos y bioquímicos como el metabolismo de ribosomas, el metabolismo de azúcares y el metabolismo de aminoácidos. Factores de transcripción como C2H2, AP2/ERF, bZIP, WRKY y MYB desempeñaron roles reguladores clave en el desarrollo de las anteras y tenían diferentes capacidades regulatorias en varias etapas. Los patrones de expresión basados en qPCR y datos de transcriptomas de los genes de factores de transcripción seleccionados mostraron consistencia, lo que sugiere que estos genes desempeñaron un papel importante en diferentes etapas de desarrollo de la flor. Estos resultados proporcionan una base teórica para la cría molecular de nuevas variedades de apio con aborto de polen. Además, han enriquecido la investigación sobre la biología reproductiva del apio y la familia Apiaceae.