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Transcriptoma análisis de posibles genes reguladores bajo duplicación química en haploides de maíz

Autores: Li, Youqiang; Zhan, Penglin; Pu, Rumin; Xiang, Wenqi; Meng, Xin; Yang, Shiqi; Hu, Gaojiao; Zhao, Shuang; Han, Jialong; Xia, Chao; Lan, Hai; Wang, Qingjun; Li, Jingwei; Lu, Yanli; Yu, Yongtao; Liao, Changjian; Li, Gaoke; Lin, Haijian

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Transcriptoma análisis de posibles genes reguladores bajo duplicación química en haploides de maíz


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Maíz
Haploide
Colchicina
Genes
Quinesina
Cromosomas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 24

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El maíz es uno de los cultivos más exitosos en cuanto a la utilización de la heterosis. La técnica de inducción haploide es uno de los métodos más rápidos para obtener material de maíz puro en la etapa actual. Sin embargo, el mecanismo molecular de la duplicación haploide rara vez se informa. En este estudio, tratamos brotes jóvenes haploides de B73 y ZNC442 con colchicina durante 0 h, 6,2 h y 10 h, y analizamos los genes diferencialmente expresados (DEGs). Encontramos que el tratamiento con colchicina durante 6,2 h y 10 h en comparación con 0 h resultó en un total de 4868 co-DEGs. El análisis de enriquecimiento GO y el análisis de vías metabólicas KEGG encontraron 282 términos GO significativamente enriquecidos y 31 vías significativas, respectivamente. Además, los genes de términos GO y vías KEGG de huso, citoesqueleto, microtúbulos y división nuclear fueron seleccionados para el análisis, y tres genes candidatos fueron seleccionados tomando intersecciones. , , y fueron anotados como proteína asociada a kinesina 13, proteína similar a kinesina KIN-10C y cadena ligera de kinesina LC6, respectivamente. Los resultados de cuantificación de fluorescencia en tiempo real (RT-PCR) revelaron que , , y tuvieron las mismas tendencias que el ARN-seq. Curiosamente, es el gen homólogo AT3G20150 en , que estuvo involucrado en la regulación del movimiento cromosómico y el ensamblaje del huso mitótico. Nuestro estudio sugiere que los genes de kinesina pueden jugar un papel importante en la duplicación de cromosomas, proporcionando así información valiosa para futuros estudios sobre los mecanismos moleculares de la duplicación cromosómica en el maíz.

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