Transcriptoma análisis de plátano (L.) en respuesta al estrés por bajo contenido de potasio
Autores: Xu, Min; Zeng, Can-Bin; He, Rui; Yan, Zhen; Qi, Zhao; Xiong, Rui; Cheng, Yu; Wei, Shuang-Shuang; Tang, Hua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2019
Acceso abierto
Artículo científico
2019
Transcriptoma análisis de plátano (L.) en respuesta al estrés por bajo contenido de potasio
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Potasio
Macronutriente
Crecimiento
Procesos de desarrollo
Análisis del transcriptoma
Estrés por bajo K
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
El potasio (K) es un macronutriente abundante e importante para las plantas. Juega roles cruciales en muchos procesos de crecimiento y desarrollo, y el crecimiento se ve inhibido bajo condiciones de bajo -K. Los mecanismos moleculares que operan bajo la carencia de K han sido poco reportados en plátano, que es una planta no modelo. Realizamos un análisis del transcriptoma de plátano (L. grupo AAA, cv. Cavendish) en respuesta al estrés por bajo -K. Los rasgos fenotípicos y perfiles transcriptómicos de hojas y raíces de plátano fueron comparados entre los grupos de bajo -K (LK) y normal -K (NK). Los parámetros fenotípicos para el grupo LK, incluyendo peso fresco y seco, fueron más bajos que los del grupo NK, lo que sugirió que el estrés por bajo -K puede inhibir algunos procesos metabólicos y biosintéticos importantes. El contenido de K y la biomasa disminuyeron en el grupo LK en comparación con el grupo NK. Tras la secuenciación de ácido ribonucleico (RNA-Seq), se detectaron un total de 26,796 genes expresados en hojas normales -K (NKL), 27,014 en hojas de bajo -K (LKL), 29,158 en raíces normales -K (NKR), y 28,748 en raíces de bajo -K (LKR). Hubo 797 genes diferencialmente expresados (DEGs) al alza y 386 DEGs a la baja en NKL versus LKL, mientras que hubo 1917 DEGs al alza y 2830 DEGs a la baja en NKR versus LKR. Esto sugirió que las raíces eran más sensibles al estrés por bajo -K que las hojas. Los DEGs relacionados con el transporte y la absorción de K fueron analizados en detalle. La clasificación funcional de genes mostró que la expresión de genes relacionados con transportadores ABC, quinasas de proteínas, factores de transcripción y transportadores de iones también fueron detectados, y pueden desempeñar roles importantes durante la deficiencia de K.
Descripción
El potasio (K) es un macronutriente abundante e importante para las plantas. Juega roles cruciales en muchos procesos de crecimiento y desarrollo, y el crecimiento se ve inhibido bajo condiciones de bajo -K. Los mecanismos moleculares que operan bajo la carencia de K han sido poco reportados en plátano, que es una planta no modelo. Realizamos un análisis del transcriptoma de plátano (L. grupo AAA, cv. Cavendish) en respuesta al estrés por bajo -K. Los rasgos fenotípicos y perfiles transcriptómicos de hojas y raíces de plátano fueron comparados entre los grupos de bajo -K (LK) y normal -K (NK). Los parámetros fenotípicos para el grupo LK, incluyendo peso fresco y seco, fueron más bajos que los del grupo NK, lo que sugirió que el estrés por bajo -K puede inhibir algunos procesos metabólicos y biosintéticos importantes. El contenido de K y la biomasa disminuyeron en el grupo LK en comparación con el grupo NK. Tras la secuenciación de ácido ribonucleico (RNA-Seq), se detectaron un total de 26,796 genes expresados en hojas normales -K (NKL), 27,014 en hojas de bajo -K (LKL), 29,158 en raíces normales -K (NKR), y 28,748 en raíces de bajo -K (LKR). Hubo 797 genes diferencialmente expresados (DEGs) al alza y 386 DEGs a la baja en NKL versus LKL, mientras que hubo 1917 DEGs al alza y 2830 DEGs a la baja en NKR versus LKR. Esto sugirió que las raíces eran más sensibles al estrés por bajo -K que las hojas. Los DEGs relacionados con el transporte y la absorción de K fueron analizados en detalle. La clasificación funcional de genes mostró que la expresión de genes relacionados con transportadores ABC, quinasas de proteínas, factores de transcripción y transportadores de iones también fueron detectados, y pueden desempeñar roles importantes durante la deficiencia de K.