En los últimos años, la transcriptómica nos ha permitido obtener una comprensión más profunda de la fisiología reproductiva fundamental, incluido el ciclo menstrual, a través de un análisis molecular más preciso. Los niveles de transcritos de mRNA endometrial fluctúan durante el ciclo menstrual normal, lo que indica cambios en el reclutamiento relativo y la abundancia de células inflamatorias, así como cambios en la receptividad y remodelación del endometrio. Además de proporcionar una comprensión más completa de los fundamentos moleculares de condiciones ginecológicas patológicas como la endometriosis, los leiomiomas y la adenomiosis a través de la secuenciación de RNA, esto ha permitido a los investigadores crear perfiles de transcriptoma durante ciclos menstruales normales y condiciones ginecológicas patológicas. Tales conocimientos podrían llevar potencialmente a terapias más específicas y personalizadas para condiciones ginecológicas benignas. Aquí, ofrecemos una visión general de los avances recientes en el análisis del transcriptoma del endometrio normal y patológico.