El pez cebra es un modelo de vertebrado establecido en el campo de la investigación biomédica. Con su pequeño tamaño, tiempo de maduración rápido y semi-transparencia en las primeras etapas de desarrollo, ha demostrado ser un modelo animal importante, especialmente para estudios de alto rendimiento. Las técnicas de imagen tridimensional, de alta resolución, no destructivas y sin etiquetas son perfectamente adecuadas para investigar estos animales en varias etapas de desarrollo. La tomografía de coherencia óptica (OCT) es una técnica de imagen óptica basada en interferometría que ha revolucionado las posibilidades de diagnóstico en el campo de la oftalmología y ha demostrado ser una herramienta poderosa para muchas aplicaciones microscópicas. Recientemente, la OCT ha encontrado su camino en la investigación de vanguardia basada en el pez cebra. Este artículo de revisión ofrece una visión general y una discusión de la literatura relevante y una perspectiva para este campo emergente.