Análisis multi-ómicos integrativos identifica la proteína de tráfico transmembrana p24 1 (TMED1) como un posible marcador pronóstico en el cáncer colorrectal
Autores: Guo, Xin; Zhou, Wei; Jin, Jinmei; Lin, Jiayi; Zhang, Weidong; Zhang, Lijun; Luan, Xin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis multi-ómicos integrativos identifica la proteína de tráfico transmembrana p24 1 (TMED1) como un posible marcador pronóstico en el cáncer colorrectal
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Cáncer colorrectal
Pronóstico
Crecimiento celular
Apoptosis
Resistencia a medicamentos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
Varios miembros de la familia de proteínas TMED están sobreexpresados en tumores malignos y asociados con la progresión tumoral. TMED1 pertenece a la familia de proteínas TMED y está involucrado en el tráfico vesicular de proteínas. Sin embargo, el nivel de expresión y el papel biológico de TMED1 en el cáncer colorrectal (CCR) aún no se han elucidado completamente. En este estudio, la integración de datos de supervivencia de pacientes y multi-ópticas (tinción inmunohistoquímica, transcriptómica y proteómica) reveló que la TMED1 altamente expresada estaba relacionada con un mal pronóstico en el CCR. La tinción con violeta de cristal indicó que el crecimiento celular se redujo después de silenciar TMED1. Además, los resultados de la citometría de flujo mostraron que la reducción de TMED1 podría aumentar la apoptosis celular. La expresión de TMED1 se correlacionó positivamente con otros miembros de la familia TMED (TMED2, TMED4, TMED9 y TMED10) en el CCR, y la red de interacción proteína-proteína sugirió su posible impacto en la regulación inmune. Además, la expresión de TMED1 se asoció positivamente con los niveles de infiltración de células T reguladoras (Tregs), fibroblastos asociados al cáncer (CAFs) y células endoteliales, y se correlacionó negativamente con los niveles de infiltración de células T CD4+, células T CD8+ y células B. Por último, se utilizaron los conjuntos de datos CTRP y GDSC en la plataforma GSCA para analizar la relación entre la expresión de TMED1 y la sensibilidad a fármacos (IC). El resultado encontró que la elevación de TMED1 se correlacionó positivamente con IC e implicó que podría aumentar la resistencia a los fármacos de las células cancerosas. Esta investigación reveló que TMED1 es un nuevo biomarcador pronóstico en el CCR y proporcionó una estrategia valiosa para analizar posibles objetivos terapéuticos de tumores malignos.
Descripción
Varios miembros de la familia de proteínas TMED están sobreexpresados en tumores malignos y asociados con la progresión tumoral. TMED1 pertenece a la familia de proteínas TMED y está involucrado en el tráfico vesicular de proteínas. Sin embargo, el nivel de expresión y el papel biológico de TMED1 en el cáncer colorrectal (CCR) aún no se han elucidado completamente. En este estudio, la integración de datos de supervivencia de pacientes y multi-ópticas (tinción inmunohistoquímica, transcriptómica y proteómica) reveló que la TMED1 altamente expresada estaba relacionada con un mal pronóstico en el CCR. La tinción con violeta de cristal indicó que el crecimiento celular se redujo después de silenciar TMED1. Además, los resultados de la citometría de flujo mostraron que la reducción de TMED1 podría aumentar la apoptosis celular. La expresión de TMED1 se correlacionó positivamente con otros miembros de la familia TMED (TMED2, TMED4, TMED9 y TMED10) en el CCR, y la red de interacción proteína-proteína sugirió su posible impacto en la regulación inmune. Además, la expresión de TMED1 se asoció positivamente con los niveles de infiltración de células T reguladoras (Tregs), fibroblastos asociados al cáncer (CAFs) y células endoteliales, y se correlacionó negativamente con los niveles de infiltración de células T CD4+, células T CD8+ y células B. Por último, se utilizaron los conjuntos de datos CTRP y GDSC en la plataforma GSCA para analizar la relación entre la expresión de TMED1 y la sensibilidad a fármacos (IC). El resultado encontró que la elevación de TMED1 se correlacionó positivamente con IC e implicó que podría aumentar la resistencia a los fármacos de las células cancerosas. Esta investigación reveló que TMED1 es un nuevo biomarcador pronóstico en el CCR y proporcionó una estrategia valiosa para analizar posibles objetivos terapéuticos de tumores malignos.