El objetivo de este trabajo fue clasificar las incubadoras de empresas en España según las cuatro fases del proceso de incubación de startups. Considerando que la tasa de graduación implica una mayor supervivencia y éxito empresarial de las empresas incubadas, se han identificado en cada etapa de la incubación (difusión del emprendimiento, pre-incubación, incubación avanzada y graduación). Se han considerado concretamente las actividades que presentan mayores impactos en el éxito de las empresas incubadas y las actividades realizadas por la incubadora de empresas que tienen una mayor relevancia en la graduación de las empresas. Se ha aplicado un análisis de clúster de componentes principales (PC). Se utilizaron simultáneamente todas las variables de incubación, reduciendo su número y agrupándolas en factores. Finalmente, los casos se agruparon según estas variables latentes. El análisis de componentes principales redujo la dimensionalidad a ocho factores con un 74% de varianza explicada. El factor 1 estaba relacionado positivamente con las variables de pre-incubación; el factor 2 estaba vinculado a variables de formación y colaboración dentro de la fase de difusión del emprendimiento. El factor 3, denominado monitoreo y control de actividades, estaba relacionado con la fase 3, o variables de incubación básica. El análisis de clúster facilita la agrupación de incubadoras de empresas en tres clústeres: Grupo 1 (16% del total), incubadoras con fuertes déficits en las fases de incubación 1, 2 y 3. Son incubadoras de empresas de pequeño tamaño, a menudo ubicadas en áreas rurales o ciudades, con una baja tasa de graduación. Grupo 2 (30%), incubadoras de empresas con una tasa de graduación muy alta y valores fuertemente positivos en los factores 1 y 2. El factor 3, aunque positivo, es susceptible de mejora. Son el grupo más grande de incubadoras de empresas y generalmente se encuentran en parques industriales y tecnológicos. El Grupo 3 (54%) es el mayoritario, con valores cercanos a los clústeres 2 y 3.