De manera única, el reloj circadiano de las cianobacterias puede ser reconstruido fuera del complejo entorno de las células vivas, simplificando en gran medida la investigación de un cronómetro biológico en funcionamiento. El componente del oscilador central está compuesto solo por tres proteínas, KaiA, KaiB y KaiC, y junto con el ATP experimentan ondas de ensamblaje y desensamblaje que impulsan los ritmos de fosforilación en KaiC. Por lo general, los puntos temporales de estas reacciones se analizan ex post facto mediante electroforesis en gel de poliacrilamida desnaturalizante, ya que esta técnica resuelve los diferentes estados de fosforilación de KaiC. Aquí, describimos un método más sensible que permite el monitoreo en tiempo real de la reacción del reloj. Al marcar una de las proteínas del reloj con un fluoróforo, en este caso KaiB, la reacción del reloj in vitro puede ser monitoreada por anisotropía de fluorescencia en una escala de tiempo de minutos durante semanas.