El conocimiento sobre la variación de temperatura dentro y entre los hábitats de aves que anidan en la playa, y cómo tal variación puede afectar el éxito de anidación y la supervivencia de estas especies, actualmente es insuficiente. Además, se necesita este tipo de datos para refinar las predicciones de cambios poblacionales debido al cambio climático, identificar hábitats de cría importantes y guiar los esfuerzos de restauración de hábitats. La imagen térmica recopilada con vehículos aéreos no tripulados (UAV) proporciona un enfoque potencial para llenar las lagunas de conocimiento actuales y lograr estos objetivos. Nuestra investigación describe una metodología novedosa para recopilar e implementar puntos de control térmico activo (GCP) y evaluar la precisión de la imagen resultante utilizando un UAV de ala fija comercial que permite la reconstrucción de paisajes térmicos con altas resoluciones espaciales, temporales y radiométricas. Además, observamos y documentamos las respuestas conductuales de las aves que anidan en la playa a los vuelos de UAV y las modificaciones realizadas a los planes de vuelo o la apariencia física del UAV para minimizar la perturbación. Encontramos evidencia sólida de que volar en días despejados y usar camuflaje azul cielo redujo significativamente la perturbación a las aves en anidación. La incorporación de los novedosos GCP térmicos activos en el flujo de trabajo de procesamiento aumentó la precisión espacial de la imagen en un promedio de 12 m horizontalmente (el error cuadrático medio de los puntos de control en imágenes con y sin GCP fue de 0.59 m y 23.75 m, respectivamente). Los índices térmicos finales generados tuvieron una distancia de muestreo en el suelo de 25.10 cm y una precisión térmica de menos de 1 grado Celsius. Este enfoque práctico para recopilar datos térmicos altamente precisos para el hábitat de aves que anidan en la playa mientras se evita la perturbación es un paso crucial hacia el monitoreo y modelado continuos de las aves que anidan en la playa y su hábitat.