Las plantas enfrentan varios tipos de estrés en sus entornos naturales y solo pueden responder efectivamente a un estrés a la vez. A través de una red génica compleja, factores de transcripción (TFs) como los TFs WRKY regulan una amplia variedad de respuestas al estrés. La clarificación de las características estructurales de las proteínas WRKY, junto con los recientes avances en simulaciones de dinámica molecular, ha arrojado luz sobre la formación, estabilidad e interacciones de los complejos de ADN-proteína. Esto ha proporcionado un nuevo enfoque con respecto al control de los TFs WRKY. La investigación de superfamilias, abarcando su desarrollo histórico, diversidad y patrones evolutivos, se ha vuelto factible gracias a la capacidad del enfoque transcriptómico para proporcionar transcripciones extensas y completas. La importancia de los TFs WRKY radica en su papel fundamental dentro de varias cascadas de señalización y redes regulatorias que influyen en las respuestas de defensa de las plantas. Esta revisión resume los aspectos funcionales de los datos de secuencias de alto volumen de TFs WRKY de diferentes especies estudiadas hasta la fecha. Además, se utilizó un enfoque de análisis comparativo para determinar las funciones de los TFs WRKY identificados en respuesta tanto a estreses abióticos como bióticos, como se reveló a través de numerosos estudios en diferentes especies de plantas. Los resultados de esta revisión serán fundamentales para comprender los eventos evolutivos y la importancia de los TFs WRKY en el contexto del cambio climático, incorporando nuevas evidencias científicas para proponer un enfoque innovador.