Las mejoras en la producción de cultivos necesarias para satisfacer la creciente demanda de alimentos en el siglo XXI dependerán de un mejor manejo de los cultivos y de variedades de cultivos mejoradas. En la última década, nuestra capacidad para utilizar la genética y la genómica en la ciencia de los cultivos ha sido revolucionada, pero estos avances no han sido igualados por nuestra capacidad para fenotipar cultivos. Dado que el fenotipado rápido y efectivo es la base de cualquier estudio genético a gran escala, hay una necesidad urgente de utilizar los recientes avances en la imagen a escala de cultivos para desarrollar un fenotipado robusto de alto rendimiento. Esta revisión discute el uso y adaptación de la termografía infrarroja (IRT) en cultivos como un recurso de fenotipado para tensiones bióticas y abióticas. En particular, aborda las complicaciones causadas por factores externos como fluctuaciones ambientales y las dificultades causadas por píxeles mixtos en la interpretación de datos de IRT y sus efectos en la sensibilidad y reproducibilidad para la detección de diferentes tensiones. Además, destaca las mejoras necesarias en el uso de esta técnica para la cuantificación de la variación genética y su integración con tecnología de múltiples sensores para su desarrollo como un enfoque de fenotipado de alto rendimiento y preciso para la cría de cultivos en el futuro.