La cría de salmón atlántico es una actividad económica clave en Chile, pero enfrenta desafíos por infestaciones de parásitos. Este parásito causa problemas de salud en los peces y pérdidas económicas para los productores. Dado que los salmones son animales poiquilotermos, su respuesta inmune puede variar con las condiciones ambientales. Este estudio analizó la respuesta transcriptómica estacional en la piel del salmón bajo condiciones de cultivo, revelando patrones distintos entre el otoño y la primavera. En otoño, la respuesta estuvo dominada por vías relacionadas con el estrés, disfunción mitocondrial y señales tempranas de reparación de tejidos. En contraste, las muestras de primavera mostraron activación de mecanismos inmunes tanto innatos como adaptativos, incluyendo activación del complemento, quimiotaxis y presentación de antígenos. Estos hallazgos sugieren que las variaciones estacionales de temperatura moldean significativamente la respuesta del huésped al desafío parasitario y deben ser consideradas en el desarrollo de estrategias de manejo efectivas en acuicultura.