Este trabajo detalla una técnica diseñada para el análisis de estructuras de radomo complejas basada en la separación no superpuesta de dos dominios diferentes: antena y radomo. Ambos dominios son analizados de forma aislada utilizando el método de momentos con el algoritmo multipolo rápido de múltiples niveles (MoM-MLFMA) para el dominio de la antena y un método modificado de funciones de base características con el enfoque de algoritmo multipolo rápido de múltiples niveles para el dominio del radomo. Luego se aplica un procedimiento iterativo para calcular el efecto de cada dominio sobre el dominio complementario. Este enfoque suele converger en pocas iteraciones, dando como resultado muy buenos resultados y mejoras significativas en eficiencia en comparación con otros enfoques eficientes como un análisis de MoM-MLFMA de onda completa del problema completo. Se incluye un caso de prueba realista, considerando un radomo con una estructura selectiva de frecuencia incrustada en una de sus interfaces. Los resultados muestran una muy buena concordancia considerando solo tres iteraciones entre dominios, requiriendo solo un tercio del tiempo de CPU necesario por el enfoque convencional.