El mapeo de campos es uno de los aspectos más importantes de la agricultura de precisión, y los drones comunitarios podrán empoderar a jóvenes emprendedores rurales que serán el reemplazo generacional de un nuevo paradigma agrosocial. Esta investigación presenta una metodología de innovación participativa agroecológica que utiliza tecnología de precisión a través de sistemas de información geográfica y vehículos aéreos no tripulados para evaluar la gestión ecológica integrada de malezas para la sustitución del glifosato en un área de transición de Citrus sinensis en San Luis Potosí, México. Se utilizaron métodos de modelado y análisis espacial respaldados por protocolos de georreferencia inteligente para determinar el número de malezas con tolerancia y resistencia al glifosato. Se realizaron cuatro vuelos de control para monitorear siete tratamientos. Las malezas resistentes al glifosato se representaron con el mayor número de individuos y frecuencia en todos los tratamientos experimentales. Aunque el tratamiento con rastrojo de maíz mostró un resultado ligeramente mejor que el uso de mantillo de Mucuna pruriens, que previene la aparición de malezas resistentes al glifosato antes de la emergencia, el segundo tratamiento se considera mejor en términos de la relación costo-beneficio, no solo por su costo significativamente más bajo, sino también por los beneficios adicionales que ofrece. Las tecnologías geoespaciales determinarán la naturaleza de los tratamientos agroecológicos para cítricos y árboles frutales y destacarán áreas de la parcela con deficiencias binomiales de nutrientes del suelo y de las plantas, así como infestaciones de plagas y enfermedades, lo que mejorará la aplicación oportuna de bioinsumos a través del desarrollo de mapas precisos de transiciones agroecológicas.