La agricultura moderna depende en gran medida de insumos químicos para mantener la productividad, sin embargo, su uso intensivo plantea riesgos ambientales y para la salud. Estrategias sostenibles basadas en bioestimulantes han surgido como alternativas prometedoras para reducir la dependencia de agroquímicos. Entre estos compuestos, las sustancias húmicas (HS) se destacan por su capacidad para modular el crecimiento de las plantas y activar respuestas de defensa. Este estudio tuvo como objetivo evaluar los efectos de las HS de diferentes fuentes: vermicompost (Vc) y turba (Pt) sobre la vía de defensa mediada por ácido salicílico (SA) en plantas de tomate (cv. Micro-Tom) infectadas con sp. Las HS fueron caracterizadas por NMR CPMAS de estado sólido para determinar la distribución relativa de grupos funcionales de carbono y dominios estructurales, incluyendo fracciones de carbono alquilo, O-alquilo, aromático y carbonilo, así como índices relacionados con la hidrofobicidad. Las actividades enzimáticas de lipoxigenasa, peroxidasa, liasa de amonio de fenilalanina y beta 1,3-glucanasa fueron determinadas espectrofotométricamente, y RT-qPCR cuantificó los niveles de transcripción génica involucrados en la señalización y defensa de SA. Ambas HS redujeron significativamente la severidad de la enfermedad y activaron genes clave de defensa relacionados con SA, incluyendo el gen regulador y los genes efectores, siendo Pt el que proporcionó mayor protección. Notablemente, las HS amplificaron la expresión génica relacionada con la defensa y las actividades enzimáticas específicamente bajo infección, mostrando una inducción más fuerte que en plantas no infectadas. Estos resultados demuestran que las diferencias estructurales entre las HS impulsan respuestas de defensa distintas y mejoradas bajo el desafío de patógenos, destacando su potencial como herramientas sostenibles para mejorar la inmunidad de las plantas en sistemas agrícolas.