Las hojas de morera, una medicina tradicional china común, representan una posible estrategia nutricional para mejorar el perfil de grasa, también conocido como lipo-nutrición, del cerdo. Sin embargo, los efectos de las hojas de morera sobre la lipo-nutrición del cerdo y los microorganismos y metabolitos en el intestino porcino siguen siendo poco claros. En este estudio, se empleó un análisis multi-ómico en un modelo animal de cerdo negro Yuxi para explorar el posible mecanismo regulador de las hojas de morera sobre la calidad de la carne de cerdo. Sesenta cerdos negros Yuxi se dividieron en dos grupos: el grupo de control (n = 15) recibió una dieta estándar, y el grupo experimental (n = 45) recibió una dieta suplementada con un 8% de hojas de morera. Los experimentos se realizaron en tres réplicas (n = 15 por réplica); se aseguró que las dos dietas fueran nutricionalmente equilibradas, y el período de alimentación fue de 120 días. Los resultados mostraron que los cerdos que recibieron la dieta suplementada con hojas de morera tenían un grosor de grasa dorsal significativamente reducido (p < 0.05) y un contenido de grasa intramuscular (IMF) aumentado (p < 0.05) en comparación con los cerdos que recibieron la dieta estándar. El análisis de lipidómica mostró que las hojas de morera mejoraron la composición del perfil lipídico y aumentaron la proporción de triglicéridos (TGs). Curiosamente, el contenido de IMF se correlacionó positivamente con el ácido graso acilo C18:2 y negativamente con C18:1 de los TGs diferenciales. Además, el análisis microbiológico cecal mostró que las hojas de morera podrían aumentar la abundancia de bacterias como UCG-005, _norank, _NK3B31_group, y . Al mismo tiempo, los niveles relativos de L-tirosina-éter etílico, éster metílico del ácido oleico, 21-deoxicortisol, N-acetildihidrosfingosina y mulberrina aumentaron. Además, encontramos que la suplementación con hojas de morera aumentó significativamente la expresión de ARNm de lipoproteína lipasa, proteína de unión a ácidos grasos 4 y receptor activado por proliferadores de peroxisomas en el músculo (p < 0.01). La suplementación con hojas de morera aumentó significativamente la expresión de ARNm de diacilglicerol aciltransferasa 1 (p < 0.05) mientras que disminuyó significativamente la expresión de acetil CoA carboxilasa en la grasa dorsal (p < 0.05). Además, la suplementación con hojas de morera aumentó significativamente la expresión de ARNm de lipasa de triglicéridos sensible a hormonas y receptor activado por proliferadores de peroxisomas alfa (p < 0.05) en la grasa dorsal. Además, la suplementación con hojas de morera condujo a un aumento de la leptina y adiponectina en suero (p < 0.01). En conjunto, este perfil ómico es consistente con un aumento de la relación de IMF a grasa dorsal en el modelo porcino.