La suplementación con luz roja lejana en la producción de agricultura en entornos controlados puede aumentar el rendimiento al activar el síndrome de evitación de sombra. Sin embargo, la efectividad de este aumento de rendimiento puede mejorarse aún más mediante la suplementación intermitente de luz roja lejana. En este estudio, se exploran los efectos de las intensidades de fotones de luz roja lejana variables y las duraciones de exposición intermitente, específicamente en intervalos de 5, 15, 30 y 45 minutos, sobre el crecimiento y desarrollo de la lechuga en fábricas de plantas, manteniendo un flujo de fotones de luz roja constante y un integral de luz diaria. Los resultados mostraron que, en comparación con la luz roja lejana constante, la luz roja lejana intermitente de 30 minutos aumentó el rendimiento en un 11.7% y el número de hojas y brotes en 2.66. Además, las diversas métricas demostraron que la suplementación intermitente de luz roja lejana mejoró la efectividad general del tratamiento de luz roja lejana. Esto se validó al analizar el contenido de fitohormonas y la expresión de genes relacionados con el metabolismo y transporte de hormonas en la punta de los tallos de lechuga. El análisis del transcriptoma reveló que las diferencias en la expresión génica entre tratamientos se concentraron principalmente en genes relacionados con la señalización, el metabolismo de hormonas y el transporte. El Análisis de Redes de Coexpresión Génica Ponderada identificó los módulos de coexpresión asociados con el rendimiento y la calidad. Además, el análisis de expresión dinámica mostró que los genes involucrados en la fotorecepción de luz roja lejana, la respuesta y el metabolismo y transporte de hormonas exhibieron respuestas rítmicas óptimas solo bajo la suplementación intermitente de luz roja lejana de 30 minutos. Esto sugiere que la irradiación intermitente de luz roja lejana en intervalos de 30 minutos es la más efectiva para activar la señalización de luz roja lejana que influye en el metabolismo y transporte de hormonas, acelerando así el crecimiento de las hojas y brotes de lechuga y, en última instancia, aumentando el rendimiento.