La presencia de antibióticos en los cultivos se debe principalmente a su riego con aguas residuales tratadas y al uso de enmiendas orgánicas de origen animal. Durante este trabajo, se evaluó el destino de los antibióticos sulfonamidas en el cultivo de tomate en dos invernaderos comerciales ubicados en Almería (España) regados con aguas residuales tratadas. Se realizaron muestreos anuales durante dos años. Las sulfonamidas en varias partes de la planta (raíces, hojas y frutos) así como en las aguas residuales tratadas, enmiendas y suelos fueron analizadas por UHPLC-MS/MS. Los resultados mostraron que las sulfonamidas se acumularon en los suelos (sulfametoxazol entre 2 y 14 ug kg; sulfadiacina, sulfatiazol, sulfapiridina, sulfameracina y sulfadimetoxina en concentraciones inferiores a 1 ug kg) y estaban presentes en las aguas residuales tratadas en concentraciones en el rango de ng L. Su distribución en las plantas dependía de la sulfonamida. Las sulfonamidas detectadas en tomate fueron sulfadiacina, sulfapiridina, sulfametazol, sulfametoxazol y sulfadimetoxina. El sulfametoxazol fue el antibiótico con la concentración más alta en el fruto de tomate, superando los 30 ug kg. Todas las sulfonamidas estaban por debajo de la Ingesta Diaria Aceptable, sin embargo, se necesitan más estudios y legislación para garantizar la seguridad alimentaria.