Este estudio investiga la influencia de la microbiota del suelo de diferentes regiones en la microbiota intestinal de las gacelas de cuello de jirafa y su papel en su adaptación a entornos extremos. Utilizando métodos de muestreo no invasivos, analizamos la composición y diversidad de la microbiota intestinal y del suelo en gacelas de cuello de jirafa en seis regiones de la Cuenca de Qaidam, en la provincia de Qinghai, China. Empleando análisis de seguimiento de fuentes y procesos de ensamblaje ecológico, este es el primer estudio que explora las variaciones de la microbiota en gacelas de cuello de jirafa en múltiples regiones. Nuestros hallazgos revelan que la microbiota derivada del suelo influye significativamente en la composición y diversidad de la microbiota intestinal en las gacelas de cuello de jirafa, moldeando sus estrategias adaptativas. La interacción entre la microbiota intestinal y la del suelo juega un papel crucial en mejorar la capacidad de las gacelas para adaptarse a entornos diversos y extremos. Notablemente, el patrón de utilización de la microbiota del suelo por la microbiota intestinal no corresponde a las tendencias regionales en la alfa-diversidad de la microbiota intestinal, posiblemente debido a variaciones en las presiones ambientales y las capacidades de filtrado intestinal de las gacelas de cuello de jirafa. Estos animales adquieren activamente bacterias de la microbiota del suelo, con la proporción influenciada por el estado de su microbiota intestinal. Este estudio subraya el papel crucial de la microbiota intestinal en la evolución de la vida silvestre y destaca las intrincadas interacciones entre la microbiota intestinal y la del suelo. Al proporcionar nuevas perspectivas sobre la co-evolución de los herbívoros y sus entornos, nuestros hallazgos contribuyen a una comprensión más profunda de los mecanismos adaptativos en los herbívoros salvajes.