La comunidad bacteriana es un factor clave que afecta el compostaje aeróbico, y entender la sucesión de la comunidad bacteriana es importante para revelar el mecanismo de degradación de la materia orgánica. En este estudio, se exploraron la sucesión y las características metabólicas de las comunidades bacterianas en 45 días de compostaje de estiércol de oveja y paja de trigo utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento y herramientas de bioinformática, respectivamente. Los resultados mostraron que la diversidad alfa de la comunidad bacteriana disminuyó significativamente en la fase termofílica (T2) y luego se recuperó gradualmente en las fases bio-oxidativas (T3) y de maduración (T4). Las comunidades bacterianas variaron en diferentes etapas, pero había 158 géneros en común entre las especies bacterianas. , , , , y fueron identificados como géneros bacterianos clave. Once géneros estaban significativamente correlacionados (< 0.05), o incluso extremadamente correlacionados (< 0.001), con los factores fisicoquímicos. El análisis de redundancia (RDA) mostró que los cambios en la diversidad de la comunidad bacteriana estaban correlacionados con factores fisicoquímicos. Las abundancias relativas más altas fueron el metabolismo de aminoácidos y carbohidratos entre los grupos metabólicos en el compost. Estos resultados proporcionarán apoyo teórico para optimizar aún más las condiciones de compostaje de estiércol de oveja y mejorar la calidad de los fertilizantes orgánicos.