El objetivo principal de este estudio fue analizar el efecto del estrés ocupacional en las intenciones de rotación, así como determinar si esta relación está mediada por los niveles de agotamiento y moderada por la motivación. El tamaño de la muestra de este estudio consistió en 603 participantes, todos empleados de la Autoridad Tributaria y Aduanera de Portugal, que forma parte del Ministerio de Finanzas y pertenece a la Administración Pública Directa. Los resultados indican que el estrés ocupacional (con los gerentes, la carrera y el salario, y la sobrecarga de trabajo) tiene un efecto positivo y significativo en las intenciones de rotación y que esta relación está mediada por el agotamiento. La motivación (intrínseca e identificada) tiene un efecto negativo y significativo en las intenciones de rotación. La motivación intrínseca modera la relación entre el estrés ocupacional (con gerentes, colegas, carrera y salario, y problemas familiares) y las intenciones de rotación. Estos resultados indican que entre las dimensiones del estrés ocupacional, las más críticas son el estrés causado por los gerentes, la sobrecarga de trabajo y la carrera y el salario. Estos son factores que la Administración Pública Directa debería considerar para reducir los niveles de estrés de los empleados, así como sus intenciones de rotación.