La orquitis autoinmune experimental (EAO) es un modelo de roedores bien establecido de autoinmunidad específica de órganos asociada con infertilidad, en el cual la inmunohistoapatología testicular ha sido estudiada extensamente. En contraste, el análisis de biopsias testiculares de pacientes infértiles asociadas con inflamación ha sido más limitado. En este trabajo, se analizaron biopsias testiculares de pacientes con azoospermia no obstructiva idiopática diagnosticada con hipospermatogénesis (HypoSp) [leve: = 9, y severa: = 11], con azoospermia obstructiva y espermatogénesis completa (grupo de control, C, = 9), y del síndrome de células de Sertoli aisladas (SCOS, = 9) para evaluar la presencia de células inmunitarias, alteraciones en espermatogonias y células de Sertoli (SCs), y niveles de hormonas reproductivas. Estos parámetros se compararon con los obtenidos en ratas con EAO. La presencia de un aumento de células CD45+ en la pared y el lumen de los túbulos seminíferos (STs) en la HypoSp severa se asocia con un aumento en el número de células germinales meióticas apoptóticas y una disminución en las poblaciones de espermatogonias indiferenciadas y diferenciadas. Las SCs mostraron un perfil inmaduro con la mayor expresión de AMH en pacientes con SCOS y HypoSp severa. En pacientes con SCOS, la cantidad de SCs/ST y SCs Ki67+ aumentó y se correlacionó con altos niveles de FSH sérica y células CD45+. En la fase severa de EAO, la infiltración de células inmunitarias y la apoptosis de células germinales meióticas aumentaron y el número de espermatogonias indiferenciadas y diferenciadas fue el más bajo, como se informó anteriormente. Aquí, encontramos que la orquitis conduce a una reducción en el número de espermatozoides, viabilidad y motilidad. Las SCs eran maduras (AMH-) pero aumentaron en número, con Ki67+ observado en STs severamente dañados y asociado con los niveles más altos de FSH y células inflamatorias. Nuestros hallazgos demuestran que en un escenario donde un proceso inflamatorio crónico está en curso, los niveles de FSH, la infiltración de células inmunitarias y los fenotipos inmaduros de las SCs están asociados con cambios severos en la espermatogénesis, lo que lleva a la azoospermia. Además, la expresión de AMH y Ki67 en las SCs es un marcador distintivo de alteraciones severas de los STs en la orquitis humana.