En la Amazonía, la Reserva de Biosfera Yasuní (RBY) es considerada un punto caliente de diversidad natural y cultural. Está poblada por varios grupos indígenas, incluidos los Kichwa, que se caracterizan por sus sistemas tradicionales de producción, los cuales son un medio de subsistencia e integración socioecológica. El objetivo de esta investigación fue evaluar la sostenibilidad de los pequeños agricultores que utilizan un sistema agroforestal tradicional dentro de las zonas de amortiguamiento, transición y núcleo de la RBY. Realizamos 133 entrevistas con jefes de hogar Kichwa. Se identificó la estructura y distribución sociodemográfica, y se utilizó la metodología de Evaluación de Sostenibilidad Inductora de Respuestas (RISE) para evaluar la sostenibilidad de los chakras según dimensiones sociales, económicas y ecológicas, expresadas mediante 10 indicadores de 50 parámetros, valorados de 0 (peor caso) a 100 (mejor caso). Los resultados se expresan en un polígono, definido por las áreas: (1) buen desempeño, (2) desempeño medio y (3) desempeño deficiente. Empleamos la técnica de clasificación jerárquica de conglomerados multivariados y el análisis de varianza (ANOVA) para identificar las disimilitudes entre grupos de chakras y la existencia de diferencias estadísticas, respectivamente. Entre los Kichwas indígenas estudiados se identificó un tipo de estructura progresiva piramidal, que es característica de poblaciones jóvenes y la no existencia de diferencias significativas entre los indicadores RISE y los chakras. Los indicadores con menor puntuación según las pautas de RISE fueron: uso de materiales y protección ambiental, producción animal, viabilidad económica y administración de chakras. Proporcionamos sugerencias para los tomadores de decisiones que apoyan a las poblaciones Kichwa en la gestión socio-productiva con objetivos de sostenibilidad. Proponemos tomar acciones en los indicadores identificados con alta prioridad para mejorar la sostenibilidad en los chakras y dinámicas sociodemográficas.