La estereología es la interpretación tridimensional de secciones bidimensionales de una estructura, ampliamente utilizada en campos como la mineralogía, la medicina y la biología. Este documento propone un software general para realizar análisis estereológicos, llamado STERapp, con una interfaz gráfica amigable para permitir la supervisión de expertos. Incluye un módulo para estimar la fecundidad de los peces (número de ovocitos maduros en el ovario), que ha sido utilizado por expertos en biología de peces en dos centros de investigación marina españoles desde 2020 para estimar la fecundidad de cinco especies de peces con diferentes estrategias reproductivas y características de ovocitos. Este módulo incluye técnicas avanzadas de visión por computadora y aprendizaje automático para reconocer y clasificar automáticamente las células en imágenes histológicas de gónadas de peces. El algoritmo de reconocimiento automático logró una sensibilidad del 55,6%, una especificidad del 64,8% y una precisión promedio del 43,1%. Las precisiones logradas para la clasificación de ovocitos fueron del 84,5% para las etapas de madurez y del 78,5% para la clasificación respecto a la presencia/ausencia del núcleo. Esto facilita el análisis y ahorra tiempo a los expertos. Por lo tanto, el cuestionario SUS reportó una puntuación media de 81,9, lo que significa que el sistema fue percibido de bueno a excelente para desarrollar análisis estereológicos para la estimación de la fecundidad de los peces.