La isomerasa de chalcona (CHI) es una enzima importante involucrada en la biosíntesis de flavonoides, crucial tanto en la defensa de las plantas como en la salud humana. Aunque muchos genes han sido previamente identificados, la función de los genes en la soja sigue siendo desconocida. En este estudio, clonamos los genes y en la soja. La reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real mostró que se expresaban principalmente en la raíz de soja, pero también estaban presentes en otros tejidos, incluyendo el tallo, la hoja y la semilla con un bajo nivel de expresión. La sobreexpresión de fue capaz de mejorar significativamente algunos rasgos beneficiosos de las raíces pilosas transformadas de cotiledón o plantas compuestas bajo condiciones de estrés salino. La longitud de la raíz, el peso húmedo de la raíz y la biomasa subterránea aumentaron, y la elevación del contenido de MDA se inhibió bajo tratamiento con NaCl de 100 mmol L o 150 mmol L. El contenido de clorofila de la hoja se elevó en plantas compuestas sobreexpresadas bajo tratamiento con NaCl de 150 mmol L. Los niveles de expresión de los genes relacionados con el estrés salino , , , y se aumentaron significativamente en las raíces pilosas sobreexpresadas en comparación con las raíces pilosas expresadas con vector vacío. Los resultados anteriores indicaron la acción potencial contra el estrés salino. Además, la sobreexpresión de y aumentó el contenido total de isoflavonas seis y tres veces, respectivamente. Los niveles de glicitina y gliciteína se elevaron significativamente en las raíces pilosas sobreexpresadas, mientras que la glicitina, genistina, daidzeína y genisteína se incrementaron significativamente en las raíces pilosas sobreexpresadas. Este estudio identificó una nueva función del gen, así como proporcionó un nuevo gen seleccionado para la tolerancia a la sal y la mejora de isoflavonas utilizando enfoques biotecnológicos en la soja.