Muchos países han cambiado gradualmente a sistemas de alojamiento amigables con el bienestar animal para las ponedoras de huevos. Sin embargo, aún no hay consenso entre los investigadores sobre si el sistema de alojamiento afecta las características de calidad del huevo. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo determinar los efectos de los sistemas de alojamiento en las características del huevo y los contenidos de aminoácidos libres de la clara y la yema utilizando dos tipos de sistemas de alojamiento: el sistema de jaulas convencional y un sistema de cría en el suelo. Las gallinas Tosa-jidori (n = 20) se dividieron en dos grupos. Los experimentos durante las 7 semanas se realizaron dos veces cambiando los sistemas de alojamiento (primer y segundo etapas). Se utilizó un análisis de varianza unidireccional para evaluar los efectos de los sistemas de alojamiento en el aumento de peso corporal, las características del huevo, los contenidos de aminoácidos de la clara y la yema, y el corticosterona fecal. Observamos efectos significativos del alojamiento en el aumento de peso corporal, el peso de la cáscara del huevo, el peso de la yema, el grosor de la cáscara del huevo, la claridad de la cáscara del huevo y varios aminoácidos de la clara (A_Gln, A_His, A_Met, A_Cys, A_Lys, A_Asp, A_Glu, A_Ser, A_Thr, A_Ala, A_Pro y A_Phe). Notablemente, se observó un efecto robusto en la claridad de la cáscara del huevo, incluso después de cambiar los sistemas de alojamiento. Estos resultados sugieren que la claridad de la cáscara del huevo y varias características del huevo, incluidos los contenidos de aminoácidos de la clara, pueden cambiarse al utilizar diferentes sistemas de alojamiento.