El brote del nuevo coronavirus ha aumentado significativamente los costos ambientales y los desafíos operativos para las aerolíneas de aviación civil, lo que ha llevado al cierre de aeropuertos en las regiones afectadas y a una disminución sustancial en el número de pasajeros. La necesidad consecuente de reevaluar, retrasar o cancelar itinerarios de vuelo ha provocado interrupciones en los aeropuertos, amplificando el riesgo de transmisión de enfermedades. En respuesta, este documento propone un enfoque espacial para abordar de manera eficiente la propagación de la pandemia en la red de aviación civil. La metodología prioriza el uso de un modelo de gravedad estático para calcular las presiones de infección específicas de las rutas, lo que permite la reprogramación estratégica de vuelos para controlar los niveles de infección en los aeropuertos (nodos) y entre las aerolíneas (bordes). Temporalmente, este estudio considera intervalos entre despegues y aterrizajes para minimizar las aglomeraciones, mitigando la tasa de transmisión del nuevo coronavirus. Al construir una red espacio-temporal discreta para vuelos irregulares, esta investigación genera un conjunto viable de rutas para aeronaves que operan en circunstancias especiales, minimizando tanto las presiones de infección específicas de las rutas como los costos operativos para las aerolíneas. Notablemente, el método introducido demuestra ahorros sustanciales, alcanzando casi el 53.4%, en comparación con los planes tradicionales. Esto muestra su eficacia en la optimización de las respuestas a las interrupciones inducidas por la pandemia dentro de la red de aviación civil, ofreciendo una solución integral que equilibra la eficiencia operativa y las consideraciones de salud pública ante desafíos sin precedentes.