La fruta de la pasión (Sims), que pertenece a la familia Passifloraceae, es una planta de importancia económica en regiones tropicales y subtropicales. Los avances en la investigación de genómica funcional de la fruta de la pasión se han visto significativamente obstaculizados por su recalcitrancia a la regeneración y transformación estable. Este estudio establece el primer sistema eficiente de transformación mediada por raíces peludas para la fruta de la pasión. Utilizando el gen marcador, se lograron inicialmente eficiencias de transformación del 11.3% con las cepas K599, MSU440 y C58C1, siendo K599 la más efectiva. Los parámetros clave de transformación fueron optimizados sistemáticamente para lograr lo siguiente: OD = 0.6, duración de la infección 30 min, concentración de acetosiringona 100 M, y un período de co-cultivo en oscuridad de 2 días. La utilidad del sistema se mejoró aún más al incorporar el marcador visual rojo RUBY, que permite la identificación directa y sin instrumentos de raíces transgénicas a través de la acumulación de betaxantina. Finalmente, este sistema se aplicó para el análisis funcional utilizando, que puede estar involucrado en la acumulación de proantocianidinas. La sobreexpresión de produjo un mayor contenido de proantocianidina en raíces peludas. Además, el gen involucrado en la vía de proantocianidinas fue fuertemente activado en las raíces peludas transgénicas. Este sistema de transformación de raíces peludas visualmente simplificado, rápido y eficiente proporciona una herramienta poderosa para estudios funcionales de genes en la fruta de la pasión.