Ampliando las posibilidades para la expresión de genes extranjeros en cucurbitáceas, presentamos un enfoque novedoso que utiliza un sistema de vectores bipartitos basado en el genoma del virus del mosaico moteado verde del pepino (CGMMV). Los vectores CGMMV de longitud completa tradicionales enfrentan limitaciones como una capacidad de carga restringida y una expresión de genes extranjeros inestable. Para abordar estos desafíos, desarrollamos dos genomas CGMMV "deconstruidos", DG-1 y DG-2. DG-1 presenta una eliminación interna importante, lo que resulta en la pérdida de dominios cruciales de la enzima replicasa, lo que lo hace incapaz de autorreplicarse. Sin embargo, una infiltración escalonada de DG-1 en plantas infectadas con CGMMV permitió la replicación y el movimiento exitosos, facilitando experimentos de silenciamiento de genes. Por el contrario, DG-2 fue diseñado para mejorar las tasas de replicación y proporcionar múltiples sitios de clonación. Aunque exhibió tasas de replicación más altas, DG-2 permaneció localizado dentro del tejido infiltrado, mostrando trans-replicación y movimiento restringido. Notablemente, DG-2 demostró utilidad en la expresión de GFP, con una expresión máxima observada entre 6 y 10 días después de la infiltración. En general, nuestro sistema bipartito representa un avance significativo en la genómica funcional, ofreciendo una herramienta robusta para la expresión de genes extranjeros en .