Diseño racional de una máquina de estados genética: combinando biología, ingeniería y matemáticas para la investigación en bioinformática
Autores: Fuente, David; Garibo i Orts, Óscar; Conejero, J. Alberto; Urchueguía, Javier F.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Diseño racional de una máquina de estados genética: combinando biología, ingeniería y matemáticas para la investigación en bioinformática
Categoría
Matemáticas
Subcategoría
Matemáticas generales
Palabras clave
éxito reciente
Ingeniería biológica
Esfuerzo de investigación
Herramientas matemáticas
Desarrollo de circuitos genéticos
Modelos.
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 31
Citaciones: Sin citaciones
El reciente éxito de la ingeniería biológica se debe a una tremenda cantidad de esfuerzo de investigación y al creciente número de oportunidades de mercado. De hecho, esto ha sido parcialmente posible gracias a la contribución de herramientas matemáticas avanzadas y la aplicación de principios de ingeniería en el desarrollo de circuitos genéticos. En este trabajo, utilizamos un circuito genético diseñado racionalmente para mostrar cómo los modelos pueden apoyar la investigación y motivar a los estudiantes a aplicar las matemáticas en sus futuras carreras. Un sistema genético de cuatro estados se analiza utilizando tres marcos: modelado determinista y estocástico a través de ecuaciones diferenciales y maestras, y un enfoque espacial a través de un autómata celular. Cada marco teórico arroja luz sobre el problema de manera complementaria. Ayuda a comprender conceptos básicos de modelado e ingeniería, como ruido, robustez y sistemas de reacción-difusión. El autómata diseñado podría ser parte de un sistema más complejo de módulos que conforman futuros biocomputadores y es un ejemplo paradigmático de cómo los modelos pueden ayudar a los profesores en la educación multidisciplinaria.
Descripción
El reciente éxito de la ingeniería biológica se debe a una tremenda cantidad de esfuerzo de investigación y al creciente número de oportunidades de mercado. De hecho, esto ha sido parcialmente posible gracias a la contribución de herramientas matemáticas avanzadas y la aplicación de principios de ingeniería en el desarrollo de circuitos genéticos. En este trabajo, utilizamos un circuito genético diseñado racionalmente para mostrar cómo los modelos pueden apoyar la investigación y motivar a los estudiantes a aplicar las matemáticas en sus futuras carreras. Un sistema genético de cuatro estados se analiza utilizando tres marcos: modelado determinista y estocástico a través de ecuaciones diferenciales y maestras, y un enfoque espacial a través de un autómata celular. Cada marco teórico arroja luz sobre el problema de manera complementaria. Ayuda a comprender conceptos básicos de modelado e ingeniería, como ruido, robustez y sistemas de reacción-difusión. El autómata diseñado podría ser parte de un sistema más complejo de módulos que conforman futuros biocomputadores y es un ejemplo paradigmático de cómo los modelos pueden ayudar a los profesores en la educación multidisciplinaria.