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La inserción de SINE en el gen de la anhidrasa carbónica 5B del cerdo está asociada con cambios en la expresión génica y variación fenotípica

Autores: Zheng, Yao; Chen, Cai; Wang, Mengli; Moawad, Ali Shoaib; Wang, Xiaoyan; Song, Chengyi

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

La inserción de SINE en el gen de la anhidrasa carbónica 5B del cerdo está asociada con cambios en la expresión génica y variación fenotípica


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Transposones
Retrotransposones
Inserción de SINE
Polimorfismo
Potenciador
Tejido adiposo

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 9

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los transposones son elementos genéticos que están presentes en los genomas de mamíferos y ocupan una gran proporción del genoma porcino, siendo los retrotransposones los más abundantes. En un estudio previo, se encontró que un retrotransposón SINE se insertó en el intrón 1 del gen en cerdos, y el presente estudio tuvo como objetivo investigar el polimorfismo de inserción SINE en este gen en diferentes razas de cerdos. Se utilizó la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para confirmar el polimorfismo en 11 razas de cerdos y jabalíes, y se encontró que había un contenido de información polimórfica moderado en 9 de las razas. Una investigación adicional en experimentos celulares reveló que la inserción SINE de 330 pb en el sitio RIP- promovió la actividad de expresión en la región del promotor débil de este sitio. Además, un experimento de verificación de vector de potenciador mostró que la secuencia SINE de 330 pb actuó como un potenciador en la región del promotor central aguas arriba de la región del gen. La expresión en tejido adiposo (grasa dorsal y grasa de hoja) en individuos con el genotipo (SINE) fue significativamente mayor que en aquellos con los genotipos (SINE) y (SINE). El análisis de asociación reveló que el genotipo (SINE) estaba significativamente asociado con un mayor grosor de grasa dorsal que el genotipo (SINE). Además, se observó que la inserción de SINE en el sitio RIP- contenía repeticiones ATTT, y se identificaron tres tipos de repeticiones (ATTT) entre diferentes individuos/razas (es decir, (ATTT), (ATTT) y (ATTT)). En general, el estudio proporciona información sobre la base genética del desarrollo del tejido adiposo en cerdos y destaca el papel de una inserción SINE en el gen en este proceso.

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