Los humedales de Cerdeña (Italia) actúan como sitios de parada para muchas aves migratorias a lo largo de la ruta migratoria de aves del Mediterráneo central y oriental. Estos humedales ahora están gravemente amenazados por actividades humanas y el cambio climático. En consecuencia, construimos un marco de simulación para predecir los efectos de varios escenarios contrafactuales y de gestión sobre el nivel de diversidad aviar en los humedales costeros de Cerdeña. Encontramos que la diversidad aviar alfa (es decir, el número medio de especies de aves por humedal) está destinada a (a) disminuir debido al aumento más probable de la salinidad del agua, los vertidos de agua y la presión turística; y (b) reducirse a la mitad (de 14.9 a 7.4, con 9 humedales de 22 que se prevé albergarán solo entre dos y cinco especies de aves acuáticas) en el peor de los escenarios posibles. Sin embargo, los resultados también mostraron que estrategias de gestión adecuadas podrían prevenir y revertir tales resultados. Las restricciones a las actividades turísticas, la desalinización del agua, la prevención de futuras intrusiones de agua salada y la prohibición de vertidos de agua podrían favorecer notablemente la diversidad aviar en estos humedales, con un aumento esperado en la diversidad aviar alfa de 14.9 a 24.8 (y 10 humedales de 22 que se prevé albergarán de 29 a 32 especies de aves acuáticas) en el mejor de los escenarios posibles. La importancia de nuestros resultados podría enfatizarse en los planes de gestión de estos importantes humedales, la mayoría de los cuales pertenecen a la red Natura 2000.