Aproximadamente el 90% de los hidratos de gas natural (HGN) del mundo existen en formaciones en aguas profundas, una nueva fuente de energía con gran potencial de explotación. Existe una distancia desde el umbral de explotación comercial basado en el pozo único actualmente utilizado. El pozo de estructura compleja es una tecnología de perforación eficiente y avanzada. La mejora de la productividad de los HGN a través de varios pozos de estructura compleja es incierta y no está completamente definida. Por lo tanto, para evaluar sus características de producción de gas, establecemos un modelo matemático para la explotación de los HGN, y luego se desarrollan y diseñan 13 conjuntos de modelos numéricos basados en los parámetros geológicos de la Fosa de Nankai en Japón, que incluyen un solo pozo vertical, un solo pozo horizontal, 1 a 4 pozos verticales de ramificación, 1 a 4 pozos horizontales de ramificación, y 2 a 4 pozos horizontales de agrupación. Los resultados de la investigación indican que los pozos con estructuras complejas representados por pozos direccionales y pozos multilaterales pueden aumentar significativamente el área de descarga de agua y gas, especialmente los pozos de agrupación, cuya productividad puede aumentar hasta 2.2 veces en comparación con los pozos individuales. Los pozos de estructura compleja jugarán un papel insustituible en la futura industrialización de los HGN.