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Abordando el plegado de resortes intermoleculares en simulaciones de partículas: convención de imagen fija

Autores: Sgouros, Aristotelis P.; Theodorou, Doros N.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Abordando el plegado de resortes intermoleculares en simulaciones de partículas: convención de imagen fija


Categoría

Ingeniería y Tecnología

Subcategoría

Ingeniería de Sistemas

Palabras clave

Simulaciones
Cadenas de polímeros
Sistemas de materia blanda
Resbalones
Enlaces intermoleculares
Topología

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 23

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las simulaciones mesoscópicas de largas cadenas de polímeros y sistemas de materia blanda se realizan rutinariamente en la literatura para evaluar los procesos de relajación de larga duración manifestados en estos sistemas. Sin embargo, las cadenas de grano grueso son propensas a entrecruzamientos no físicos debido a su suavidad inherente. Este problema puede resolverse introduciendo largos enlaces intermoleculares (llamados muelles deslizantes) que restauran estas restricciones topológicas. El vector de separación de los enlaces intermoleculares puede determinarse haciendo cumplir la convención de imagen mínima (MIC) comúnmente adoptada. Dado que estos enlaces son suaves y largos (aprox. 3-20 nm), someter las muestras a deformaciones extremas puede llevar a violaciones topológicas al hacer cumplir la MIC. Proponemos la convención de imagen fija (FIC) para determinar los vectores de separación de enlaces sobredimensionados, que es más estable que la MIC y aplicable a deformaciones extremas. La FIC es simple de implementar y, en general, más eficiente que la MIC. Las comparaciones lado a lado entre la MIC y la FIC demuestran que, al usar la FIC, la topología permanece intacta incluso en situaciones con desplazamiento de partículas extremo y deformación no afín. La precisión de estas convenciones es la misma al aplicar deformación afín. El artículo está acompañado por el código correspondiente para implementar la FIC.

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