(1) Antecedentes: El ácido cinámico (CA) es una sustancia dañina secretada por las raíces de cultivos de monocultivo. (2) Métodos: Este estudio tuvo como objetivo investigar cómo el Si exógeno afecta el contenido de clorofila y el metabolismo del carbono en plántulas de pepino bajo estrés inducido por CA. (3) Resultados: Los niveles de clorofila a, clorofila b, clorofila a+b y carotenoides se redujeron significativamente debido al estrés inducido por CA. La adición de Si exógeno alivió significativamente esta reducción. Bajo estrés inducido por CA, el Si exógeno aumentó significativamente las actividades de la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa, gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa, fructosa-1,6-bisfosfatasa, fructosa-1,6-bisfosfato aldolasa y transchetolasa. El estrés inducido por CA aumentó significativamente los contenidos de fructosa, glucosa y sacarosa y redujo el contenido de almidón en las hojas y raíces de las plántulas. De manera similar, las actividades de la sacarosa fosfato sintasa, sacarosa sintasa, invertasa ácida e invertasa neutra se redujeron significativamente en las plantas bajo estrés inducido por CA. En general, el Si exógeno redujo significativamente el contenido de azúcares solubles, aumentó el contenido de almidón y promovió la actividad enzimática relacionada con el metabolismo de la sacarosa en las plántulas. (4) Conclusión: El Si exógeno puede aumentar efectivamente el contenido de pigmentos fotosintéticos en las hojas de las plántulas y mantener el equilibrio del potencial osmótico en la planta al reducir la acumulación de productos de asimilación de carbono, lo que en última instancia promueve la tolerancia al estrés autotóxico inducido por CA.