Las modificaciones epigenéticas son indispensables para regular los cuerpos de los genes y el silenciamiento de los elementos transponibles (ET). La DISMINUCIÓN EN LA METILACIÓN DEL ADN 1 (DDM1) es un remodelador de la cromatina involucrado en modificaciones de histonas y metilación del ADN. Además de mantener el epigenoma, DDM1 también mantiene características clave de las plantas, como el tiempo de floración y la heterosis. El papel de DDM1 en la regulación epigenética está mejor caracterizado en plantas, especialmente en arabidopsis, arroz, maíz y tomate. Los cambios epigenéticos inducidos por DDM1 establecen la herencia estable de muchas características de las plantas durante al menos ocho generaciones, sin embargo, DDM1 no metila genes que codifican proteínas. El mecanismo de silenciamiento de ET de DDM1 es distinto y ha evolucionado independientemente de otras vías de silenciamiento. A diferencia de la vía de Metilación del ADN dirigida por ARN (RdDM), DDM1 no depende de siARN para hacer cumplir el estado heterocromático de los ET. Aquí, revisamos la actividad de silenciamiento de ET de DDM1 en los contextos de RdDM y no-RdDM. La maquinaria de silenciamiento de ET de DDM1 está fuertemente asociada con la histona de enlace H1 y la histona H2A.W. Mientras que la histona de enlace H1 excluye a los factores de RdDM de metilar la heterocromatina, la variante de histona H2A.W previene la movilidad de los ET. La estrategia DDM1-H2A.W por sí sola silencia casi todos los ET móviles en el genoma de arabidopsis. Así, el silenciamiento de ET dirigido por DDM1 preserva esencialmente las características heterocromáticas y elimina las amenazas móviles a la estabilidad del genoma.