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SGCNCMI: Un Nuevo Modelo que Combina Información Multi-Modal para Predecir miARNs Relacionados con circRNA, Enfermedades y Genes

Autores: Yu, Chang-Qing; Wang, Xin-Fei; Li, Li-Ping; You, Zhu-Hong; Huang, Wen-Zhun; Li, Yue-Chao; Ren, Zhong-Hao; Guan, Yong-Jian

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico
2022

SGCNCMI: Un Nuevo Modelo que Combina Información Multi-Modal para Predecir miARNs Relacionados con circRNA, Enfermedades y Genes


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Predicción computacional
MiARNs
Enfermedades
Genes
CircARNs
Asociaciones

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 14

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La predicción computacional de miARN, enfermedades y genes asociados con circARN tiene importantes implicaciones para la investigación de circARN, así como proporciona una referencia para experimentos en laboratorio que ahorran costos y tiempo. En este estudio, SGCNCMI, un modelo computacional que combina información multimodal y redes neuronales convolucionales gráficas, combina la similitud de nodos para formar información de nodos y luego predice nodos asociados utilizando GCN con un mecanismo de contribución distributiva. El modelo se puede utilizar no solo para predecir el nivel molecular de las interacciones circARN-miARN, sino también para predecir asociaciones circARN-cáncer y circARN-gene. Los AUC de las asociaciones circARN-miARN, circARN-enfermedad y circARN-gene en el experimento de validación cruzada de cinco pliegues de SGCNCMI son 89.42%, 84.18% y 82.44%, respectivamente. SGCNCMI es uno de los pocos modelos en este campo y logró los mejores resultados. Además, en nuestro estudio de caso, seis de los diez pares de relaciones con las puntuaciones de predicción más altas fueron verificados en PubMed.

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