El emblemático león marino de Galápagos (GSL) ha enfrentado un importante declive poblacional en las últimas cuatro décadas. Existen múltiples factores ambientales y biológicos que podrían estar implicados en esta disminución. Recientemente, se ha informado sobre la evidencia de varias enfermedades infecciosas zoonóticas que pueden ser amenazas potenciales. Considerando que en algunas islas del archipiélago el riesgo de transmisión de enfermedades infecciosas puede ser promovido por el aumento de la población de perros domésticos, la vigilancia epidemiológica y la búsqueda de nuevos patógenos son esenciales. El virus del moquillo canino (CDV), uno de los patógenos virales que generan mayor preocupación para las agencias responsables de la gestión y conservación de los pinnípedos de Galápagos, fue detectado en el GSL en 2010. Sin embargo, hay escasa información sobre su impacto en la salud del GSL y sobre su epidemiología. En este estudio, se recolectaron 110 muestras de suero de GSL durante el verano de 2016 y 2017. Todas las muestras fueron expuestas a células VERO SLAM de perro que expresan el receptor SLAM canino. Nuestros resultados mostraron un aumento significativo en la frecuencia de anticuerpos neutralizantes al CDV en las muestras de 2017 (53.1%) en comparación con las muestras de 2016 (19.6%). Nuestro trabajo confirmó la circulación continua y creciente del CDV en el GSL y destaca la importancia de monitorear enfermedades emergentes que pueden ser transmitidas de especies domésticas a especies silvestres. La vigilancia del CDV es esencial para entender el papel de este virus en la mortalidad del GSL y para tomar decisiones informadas para la conservación de la vida silvestre.