La industria de la madera genera grandes cantidades de residuos de biomasa de follaje. Debido a las crecientes aplicaciones y mercados para los aceites esenciales (AE), los residuos de follaje fresco de Azores (Az-CJF) se utilizan para la producción local de AE. La hidrodestilación (HD), un proceso común para obtener AE, también ofrece la posibilidad de fraccionarlos. Así, este estudio evaluó las actividades antimicrobianas y antioxidantes in vitro de seis fracciones de AE de Az-CJF (Frs. 1-6), recolectadas en intervalos de tiempo de HD secuenciales (HDT: 0-2, 2-10, 10-30, 30-60, 60-120 y 120-240 min), en comparación con el AE crudo, obtenido de una HD no fraccionada (0-240 min HDT). Las actividades antimicrobianas se evaluaron mediante el método de difusión en disco contra siete bacterias (patógenos alimentarios y/o humanos) y dos spp. (hongos fitopatógenos), y la actividad antioxidante se estimó utilizando ensayos de DPPH y ABTS. En cuanto a la actividad antibacteriana, todas las muestras de AE fueron efectivas solo contra bacterias Gram-positivas. Las fracciones 1-3 (30 min HDT) exhibieron las actividades antioxidantes más fuertes (valores de EC: 1.5-2.3 y 1.0-1.7 mg mL para DPPH y ABTS, respectivamente), siendo al menos 1.3 veces más altas que las del AE crudo. La presencia de isómeros de nezukol, elemol y eudesmol podría contribuir fuertemente a las mejores propiedades de captura de radicales libres de las Frs. 4-6. En conclusión, se encontró que la HD era un proceso eficiente para obtener nuevas fracciones de AE de Az-CJF con bioactividades variables y mejoradas debido a su composición diferencial, como se evaluó mediante GC-MS. Por lo tanto, estos hallazgos podrían contribuir a aumentar el potencial comercial de la industria de AE, a saber, las Fr2 y Fr6, que presentaron las actividades más significativas y pueden tener aplicaciones potenciales en los sectores de alimentos, medicina y agricultura.