Los virus producen ácidos nucleicos durante su replicación, ya sea durante la replicación genómica o la transcripción. Estos ácidos nucleicos están presentes en el citoplasma o endosoma de una célula infectada, o en el espacio extracelular para ser detectados por células vecinas durante infecciones líticas. Las células tienen mecanismos para detectar ácidos nucleicos generados por virus; estos ácidos nucleicos actúan como banderas para la célula, indicando una infección que requiere mecanismos de defensa. Los ácidos nucleicos virales se llaman patrones moleculares asociados a patógenos (PAMPs) y los sensores que se unen a ellos se llaman receptores de reconocimiento de patrones (PRRs). Este artículo de revisión se centra en los hallazgos más recientes sobre los PRRs de ácidos nucleicos en peces, incluyendo: receptores tipo Toll (TLRs), receptores similares a RIG-I (RLRs), sensores de ADN citoplasmático (CDSs) y receptores de limpieza de clase A (SR-As). También se discute lo que se conoce actualmente sobre las moléculas de señalización en la vía de cada familia de PRR y la respuesta antiviral resultante, ya sea producción de interferones tipo I (IFNs) o citoquinas proinflamatorias. La revisión destaca lo que se sabe, pero también define lo que aún requiere elucidación en este animal de importancia económica. Comprender los sistemas inmunitarios innatos frente a infecciones virales ayudará en el desarrollo de mejores terapias antivirales y vacunas para el futuro.