Los árboles hortícolas reproductivamente maduros pasan por un ciclo anual de floración que se repite cada año de su vida reproductiva. Este ciclo anual de floración es crítico para la productividad de los árboles hortícolas. Sin embargo, los eventos moleculares que subyacen a la regulación de la floración en cultivos de árboles tropicales como el aguacate no están completamente entendidos ni documentados. En este estudio, investigamos las posibles señales moleculares que regulan el ciclo de floración anual en el aguacate durante dos ciclos de cultivo consecutivos. Se identificaron y evaluaron homólogos de genes relacionados con la floración para sus perfiles de expresión en varios tejidos a lo largo del año. Los homólogos de aguacate de genes florales conocidos fueron regulados al alza en el momento típico de inducción floral para los árboles de aguacate que crecen en Queensland, Australia. Sugerimos que estos son posibles marcadores candidatos para la iniciación floral en estos cultivos. Además, se observó que los genes asociados con la endodormancia fueron regulados a la baja en el momento de la ruptura de los brotes florales. En este estudio, no se observó una correlación positiva entre la activación y la regulación de la floración en las hojas de aguacate. Además, el modelo descrito en plantas anuales parece estar conservado en el aguacate. Por último, no se observó correlación de los miARNs relacionados con la juvenilidad miR156, miR172 con ningún evento fenológico.