Selección Genómica para el Peso al Destete en Ovejas Merino Alpinas Basada en Información de Marcadores Previos de GWAS
Autores: Wang, Haifeng; Li, Chenglan; Li, Jianye; Zhang, Rui; An, Xuejiao; Yuan, Chao; Guo, Tingting; Yue, Yaojing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Selección Genómica para el Peso al Destete en Ovejas Merino Alpinas Basada en Información de Marcadores Previos de GWAS
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Valores genéticos de cría estimados genómicamente
Método GBLUP
Información previa de marcadores
Estudio de asociación a nivel del genoma
Rasgo de peso al destete
Ovejas Merino de las tierras altas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Este estudio tiene como objetivo comparar la precisión de los valores genómicos de cría estimados (GEBV) utilizando un método de predicción lineal mejor ajustada genómica (GBLUP) y las estimaciones de GEBV que incorporan información previa de marcadores de un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) para el rasgo de peso al destete en ovejas Merino de alta montaña. El objetivo es proporcionar apoyo teórico y técnico para mejorar la precisión de la selección genómica. El estudio utilizó una población de 1007 ovejas Merino de alta montaña, con el peso al destete a los 3 meses como el rasgo objetivo. La población se dividió aleatoriamente en dos grupos. El primer grupo se utilizó para el análisis GWAS para identificar marcadores significativos, y se seleccionaron los marcadores del 5%, 10%, 15% y 20% superiores como información previa de marcadores. El segundo grupo se utilizó para estimar parámetros genéticos y comparar la precisión de las predicciones de GEBV utilizando diferentes informaciones previas de marcadores. La precisión se obtuvo utilizando una validación cruzada de cinco pliegues. Finalmente, ambos grupos fueron sometidos a validación cruzada. Los hallazgos del estudio revelaron que la heredabilidad del rasgo de peso al destete, calculada utilizando el modelo GBLUP, osciló entre 0.122 y 0.394, con precisiones de predicción correspondientes que variaron entre 0.075 y 0.228. Al incorporar información previa de marcadores de GWAS, la heredabilidad se mejoró a un rango de 0.125 a 0.407. La inclusión del 5% al 20% de los SNP significativos de los resultados de GWAS como información previa en la selección genómica mostró potencial para mejorar la precisión de la predicción del valor genómico de cría.
Descripción
Este estudio tiene como objetivo comparar la precisión de los valores genómicos de cría estimados (GEBV) utilizando un método de predicción lineal mejor ajustada genómica (GBLUP) y las estimaciones de GEBV que incorporan información previa de marcadores de un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) para el rasgo de peso al destete en ovejas Merino de alta montaña. El objetivo es proporcionar apoyo teórico y técnico para mejorar la precisión de la selección genómica. El estudio utilizó una población de 1007 ovejas Merino de alta montaña, con el peso al destete a los 3 meses como el rasgo objetivo. La población se dividió aleatoriamente en dos grupos. El primer grupo se utilizó para el análisis GWAS para identificar marcadores significativos, y se seleccionaron los marcadores del 5%, 10%, 15% y 20% superiores como información previa de marcadores. El segundo grupo se utilizó para estimar parámetros genéticos y comparar la precisión de las predicciones de GEBV utilizando diferentes informaciones previas de marcadores. La precisión se obtuvo utilizando una validación cruzada de cinco pliegues. Finalmente, ambos grupos fueron sometidos a validación cruzada. Los hallazgos del estudio revelaron que la heredabilidad del rasgo de peso al destete, calculada utilizando el modelo GBLUP, osciló entre 0.122 y 0.394, con precisiones de predicción correspondientes que variaron entre 0.075 y 0.228. Al incorporar información previa de marcadores de GWAS, la heredabilidad se mejoró a un rango de 0.125 a 0.407. La inclusión del 5% al 20% de los SNP significativos de los resultados de GWAS como información previa en la selección genómica mostró potencial para mejorar la precisión de la predicción del valor genómico de cría.