Los cerdos Wuzhishan (WZS), que son minipigs nativos de la provincia de Hainan en China, se caracterizan por su fuerte resistencia a temperaturas extremas y humedad. La relación entre su respuesta inmune y crecimiento aún necesita ser aclarada. En este estudio, utilizamos la secuenciación del genoma completo (WGS) para detectar variaciones en 37 cerdos WZS, 32 cerdos Large White (LW) y 22 cerdos negros Xiangxi (XXB), y se obtuvieron aproximadamente 2.49 GB de SNPs. Estos datos se combinaron con los de otras dos razas de cerdos, y se encontró que la mayoría de los genes detectados (354) estaban ubicados dentro de las regiones genéticas distintas entre los cerdos WZS y los cerdos LW. La red que se construyó utilizando estos genes representó un centro que incluía 12 genes clave, cinco de los cuales tenían variaciones estructurales (SVs) dentro de sus regiones reguladoras. Además, los datos de RNA-seq y RT-qPCR para 12 genes fueron principalmente consistentes en tejidos de hígado, bazo y LDM. Notablemente, la expresión de HSPs fue más alta mientras que la de la mayoría de los genes involucrados en la vía JAK3-STAT fue más baja en el tejido hepático de los cerdos WZS, en comparación con los cerdos LW. Esto probablemente no solo redujo la respuesta inmune relacionada con la inflamación, sino que también afectó su crecimiento. Nuestros hallazgos demostraron el papel de las HSPs en la conexión entre la inflamación y la tasa de crecimiento, al tiempo que proporcionaron la selección genética fundamental de la adaptabilidad de los cerdos WZS.