Las microalgas son una materia prima prometedora con actividad bioestimulante comprobada que se ve potenciada por sus componentes bioquímicos (por ejemplo, aminoácidos y fitohormonas), lo que las convierte en una materia prima atractiva para reducir el uso de fertilizantes en la agricultura y mejorar la productividad y resiliencia de los cultivos. Así, este trabajo tuvo como objetivo aislar mutantes microalgales ricos en proteínas con mayor actividad bioestimulante. Se realizó mutagénesis aleatoria y se seleccionaron mutantes ricos en proteínas a través de la clasificación de células activadas por fluorescencia (FACS), lo que resultó en el aislamiento de 17 cepas mutantes ricas en proteínas con contenidos proteicos entre un 19% y un 34% superiores al del tipo salvaje (WT). Además, el mutante F4 mostró una productividad de biomasa, tasa de crecimiento y contenido de clorofila superiores en un 38%, 22% y 62%, respectivamente. Este mutante se escaló a un reactor de banco de 7 L para producir biomasa y evaluar el potencial bioestimulante de esta nueva cepa en semillas de berro de jardín. En comparación con el agua (control), el índice de germinación y el crecimiento total relativo aumentaron en un 7% y un 19%, respectivamente, después de la aplicación de 0.1 g L de este bioproducto, lo que resalta su potencial bioestimulante.