Selección y validación de genes de referencia óptimos para RT-qPCR para la normalización de la expresión génica bajo diferentes condiciones experimentales en
Autores: Liu, Hongli; Liu, Jing; Chen, Peng; Zhang, Xin; Wang, Ke; Lu, Jiuxing; Li, Yonghua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Selección y validación de genes de referencia óptimos para RT-qPCR para la normalización de la expresión génica bajo diferentes condiciones experimentales en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Planta
Genes
Referencia
Análisis
Molecular
Desarrollo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
, una planta de hoja ancha perenne que se utiliza como planta ornamental en paisajismo y planta medicinal, es una especie de árbol ecológicamente importante y dominante. Sin embargo, se conoce poco sobre los mecanismos moleculares de su crecimiento, desarrollo y metabolismo. La selección de genes de referencia adecuados es crítica para los análisis biológicos moleculares. Hasta la fecha, no se ha realizado ninguna investigación sobre genes de referencia como base para el análisis de expresión génica en . En este estudio, se seleccionaron 14 genes candidatos de la base de datos del transcriptoma de para el ensayo de RT-qPCR bajo diferentes condiciones. Los resultados mostraron que y eran los más estables en diferentes tejidos de plántulas y árboles adultos. Para diferentes etapas de desarrollo de las hojas, la mejor combinación de genes de referencia fue y . y fueron los mejores bajo tratamiento de frío, mientras que y fueron los mejores bajo tratamiento de calor. Finalmente, se utilizó un ensayo de RT-qPCR de y genes para verificar aún más la fiabilidad de los genes de referencia seleccionados anteriormente. Este trabajo es el primero en seleccionar y evaluar la estabilidad de los genes de referencia para la normalización del análisis de expresión génica en y proporcionará una base importante para futuros estudios genéticos de esta especie.
Descripción
, una planta de hoja ancha perenne que se utiliza como planta ornamental en paisajismo y planta medicinal, es una especie de árbol ecológicamente importante y dominante. Sin embargo, se conoce poco sobre los mecanismos moleculares de su crecimiento, desarrollo y metabolismo. La selección de genes de referencia adecuados es crítica para los análisis biológicos moleculares. Hasta la fecha, no se ha realizado ninguna investigación sobre genes de referencia como base para el análisis de expresión génica en . En este estudio, se seleccionaron 14 genes candidatos de la base de datos del transcriptoma de para el ensayo de RT-qPCR bajo diferentes condiciones. Los resultados mostraron que y eran los más estables en diferentes tejidos de plántulas y árboles adultos. Para diferentes etapas de desarrollo de las hojas, la mejor combinación de genes de referencia fue y . y fueron los mejores bajo tratamiento de frío, mientras que y fueron los mejores bajo tratamiento de calor. Finalmente, se utilizó un ensayo de RT-qPCR de y genes para verificar aún más la fiabilidad de los genes de referencia seleccionados anteriormente. Este trabajo es el primero en seleccionar y evaluar la estabilidad de los genes de referencia para la normalización del análisis de expresión génica en y proporcionará una base importante para futuros estudios genéticos de esta especie.