El análisis de las firmas de selección en los genomas de los animales de granja permite la detección de regiones genómicas afectadas por la selección y contribuye a la identificación de genes subyacentes a rasgos adaptativos y productivos. Esta investigación tuvo como objetivo identificar loci bajo presión de selección y detectar genes candidatos en ovejas Dzhalgin Merino mediante un análisis genómico comparativo con las razas australianas Merino y Rambouillet. Se incluyeron un total de 293 animales en el análisis, que comprendían Dzhalgin Merino (n = 53), Australian Merino (n = 50), Australian Industry Merino (n = 88) y Rambouillet (n = 102). Los datos de genotipado de SNP de todo el genoma para Dzhalgin Merino se generaron en este estudio, mientras que los datos para Australian Merino, Australian Industry Merino y Rambouillet se obtuvieron del proyecto SheepHapMap. Para los fines del análisis, Australian Merino y Australian Industry Merino se combinaron en un solo grupo (n = 138). Para mejorar la fiabilidad de los resultados, se emplearon tres métodos independientes para detectar firmas de selección: el índice de fijación (FST), el análisis de la variación del desequilibrio de ligamiento (varLD) y el número de sitios segregantes por longitud en poblaciones cruzadas (xp-nSL). El estudio mostró que Dzhalgin Merino tiene firmas genéticas únicas potencialmente asociadas con la adaptación y la productividad, lo que abre nuevas oportunidades para su selección. Los genes identificados pueden convertirse en la base para desarrollar nuevos programas de cría destinados a mejorar tanto las cualidades productivas como las habilidades adaptativas de la raza. La investigación futura debería centrarse en una investigación detallada de la estructura genética dentro de los loci bajo presión de selección y en aclarar los mecanismos por los cuales estos genes influyen en los fenotipos animales. Se identificaron un total de 185 genes dentro de las regiones genómicas que exhiben firmas de selección. Entre estos, se prestó especial atención a , , , , , , y , que están involucrados en procesos biológicos como el crecimiento, el desarrollo y la reproducción. Los genes identificados representan objetivos potenciales para programas de cría destinados a aumentar la productividad y la capacidad adaptativa de la raza.